El WHS está causado por una deleción parcial del brazo corto del cromosoma 4.
Alrededor del 87% de los casos representan una deleción de novo, mientras que el 13% aproximadamente son heredados por una translocación cromosómica parental.
Un pequeñísimo porcentaje de los casos se produce por reorganizaciones cromosómicas más complejas, como el anillo del cromosoma 4, una anomalía inusual que ocurre cuando el cromosoma se rompe en dos partes y los extremos del cromosoma se fusionan formando una estructura circular, conllevando en el proceso la perdida de las regiones de los extremos.
La región delecionada suele afectar particularmente a los genes WHSC1-WHSC2,
LETM1 y MSX1. Los fallos producidos por la pérdida de estos genes son:
- WHSC1: siglas de "Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 1" y también conocido como MMSET, se asocia con muchas de las características faciales y el retraso del desarrollo. Este gen codifica para tres proteínas (MMSET I, MMSET II y RE-IIBP) que se encuentran activas antes y después del nacimiento en muchas células y tejidos del organismo. Además esta implicado en procesos de reparación del DNA.
- LETM1: siglas de "Leucine zipper-EF-hand containing transmembrane protein 1", parece estar asociado con las convulsiones y otras anomalías de la actividad eléctrica del cerebro además de la falta de tono muscular en los pacientes con WHS.. La proteína que codifica se activa en la mitocondria, donde puede estar implicada en el transporte de iones de calcio a través de las membranas mitocondriales y en la determinación de la forma y el volumen de las mitocondrias.
- MSX1: siglas de "msh homeobox 1", es responsable de las anormalidades dentales, el labio leporino y el paladar hendido. Este gen actúa en el desarrollo temprano, controlando la formación de muchas estructuras corporales. Especialmente, su función es crítica para el normal desarrollo de los dientes y otras estructuras bucales. También parece ser importante para las uñas de manos y pies.
- El receptor del factor de crecimiento de fibroblastos tipo 1 (FGFRL1) gen, localizado en 4p16.3, representa un gen candidato plausible para una parte del fenotipo craneofacial de WHS. FGFRL1 está involucrado en el hueso y cartílago durante el desarrollo embrionario.
- FGFR3: es un receptor celular de fatores de crecimiento . se expresa durante el desarrollo en mchas zonas del sistema nervioso y de los huesos . Su falta es reponsable de la acondroplasia , enanismo, y otras alteraciones del desarrollo oseo y cartilaginoso. Su exceso esta implicado en tumores humanos.
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